Abstract LB-89: Germ-line and somatic SMARCA4 mutations characterize small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Small-cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT) is an aggressive tumor and the most common type of undifferentiated ovarian malignancy presenting at less than 40 years of age. Its cause and histogenesis remain unknown. We sequenced the exomes of individuals from three familial cases of SCCOHT. Subsequently, we used whole exome sequencing, Sanger sequencing and immunohistochemistry to analyze germline and tumor DNA from three additional familial cases, 35 non-familial cases and one SCCOHT cell line (BIN-67). DNA sequencing revealed likely deleterious germ-line mutations in the chromatin remodeling gene SMARCA4 in all four familial cases of SCCOHT where DNA was available. This was accompanied by either a somatic mutation or loss of the wild-type allele in the tumor. BIN-67 contained bi-allelic deleterious mutations in SMARCA4. Sequencing of 24 non-familial pathologically-confirmed SCCOHT cases revealed at least one germ-line or somatic likely deleterious SMARCA4 mutation in 22 cases. Immunohistochemical (IHC) analyses of these and an additional 11 tumors showed loss of BRG1 protein in 38/40 cases. Our findings identify alterations in SMARCA4 as a major cause of SCCOHT, which could pave the way for genetic counseling and new treatment approaches. Citation Format: Leora Witkowski, Jian Carrot-Zhang, Steffen Albrecht, Nancy Hamel, Eva Tomiak, David Grynspan, Emmanouil Saloustros, Catherine Gilpin, Rachel Silva-Smith, François Plourde, Barbara Rivera, Ester Castellsagué, Mona Wu, Somayyeh Fahiminiya, Javad Nadaf, Avi Saskin, Madeleine Arseneault, Rouzan G. Karabakhtsian, Elizabeth A. Reilly, Frederick R. Ueland, Anna Margiolaki, Kitty Pavlakis, Sharon M. Castellino, Janez Lamovec, Lawrence M. Roth, Thomas M. Ulbright, Tracey Bender, Michel Longy, Andrew Berchuck, Marc Tischkowitz, Reiner Siebert, Inga Nagel, Vassilis Georgoulias, Colin J.r. Stewart, Glenn McCluggage, Jocelyne Arseneau, Blaise A. Clarke, Yasser Riazalhosseini, Martin Hasselblatt, Jacek Majewski, William D. Foulkes. Germ-line and somatic SMARCA4 mutations characterize small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr LB-89. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-LB-89
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».