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Enregistrement W2095597298 · doi:10.7603/s40681-015-0002-0

The current progress and future prospects of personalized radiogenomic cancer study

2015· article· en· W2095597298 sur OpenAlexaff
Juhn-Cherng Liu, Wu‐Chung Shen, Tzu‐Ching Shih, Chia-Wen Tsai, Wen-Shin Chang, Der‐Yang Cho, Chang‐Hai Tsai, Da‐Tian Bau

Notice bibliographique

RevueBiomedicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEffects of Radiation Exposure
Établissements canadiensTerry Fox Research Institute
Organismes subventionnairesChina Medical University
Mots-clésRadiogenomicsPersonalized medicineMedicineRadiation therapyPrecision medicineCancerBioinformaticsComputational biologyPathologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During the last twenty years, mounting studies have supported the hypothesis that there is a genetic component that plays an important role in clinically observed variability in individual tissue/organ toxicity after radiotherapy. We propose the term "Personalized Radiogenomics" for the translational study of individual genetic variations that may associate with or contribute to the responses of tissues to radiation therapy used in the treatment of all types of cancer. The missions of personalized radiogenomic research are 1) to reveal the related genes, proteins, and biological pathways responsible for non-tumor or tumor tissue toxicity resulting from radiotherapy that could be targeted with radio-sensitizing and/or radio-protective agents, and 2) to identify specific genetic markers that can be used in risk prediction and evaluation models before and after clinical cancer surgery. For the members of the Terry Fox Cancer Research Lab in China Medical University and Hospital, the long-term goal is to develop SNP-based risk models that can be used to stratify patients to more precisely tailored radiotherapy protocols. Worldwide, the field has evolved over the last two decades in parallel with rapid advances in genetic and genomic technology, moving step by step from narrowly focused candidate gene studies to large-scale, collaborative genome-wide association studies. This article will summarize the candidate gene association studies published so far from the Terry Fox Cancer Research Lab as well as worldwide on the risk of radiation-related cancers and highlight some wholegenome association studies showing feasibility in fulfilling the dream of personalized radiogenomic cancer therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,420
Score d'incertitude au seuil0,274

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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