Genetic structure of raccoons in eastern North America based on mtDNA: implications for subspecies designation and rabies disease dynamics
Notice bibliographique
Résumé
Subspecific designations are useful for wildlife management when they represent real barriers to gene flow. In this study, we assess genetic partitioning of mitochondrial DNA control region variation to determine if the structuring is congruent with morphologically defined subspecies of the common raccoon (Procyon lotor (L., 1758)). Mitochondrial control region sequences were analyzed within and among four subspecies ( Procyon lotor elucus Bangs, 1898, Procyon lotor lotor (L., 1758), Procyon lotor hirtus Nelson and Goldman, 1930, and Procyon lotor varius Nelson and Goldman, 1930) that occur along the eastern seaboard of North America through to the central United States. This identified 76 haplotypes, 59 of which were specific to one of the four ranges, while only 1 haplotype was wide-spread. Phylogenetic analysis revealed three distinct lineages: one found primarily in Florida, one along the eastern seaboard, and the third predominantly to the west of the Mississippi River. These lineages likely diverged during the Pleistocene, as a result of rising sea levels creating barriers to gene flow. The range of P. l. elucus is still primarily one lineage supporting the subspecific designation; however, there is considerable lineage mixing across the ranges of P. l. hirtus, P. l. lotor, and P. l. varius, suggesting that they be synonymized to P. l. lotor. While some of these subspecies designations are not supported, we have found that landscape attributes affect gene flow, which can be of use in informing rabies management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».