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Enregistrement W2095781438 · doi:10.1111/j.1751-7915.2009.00077.x

Field metabolomics and laboratory assessments of anaerobic intrinsic bioremediation of hydrocarbons at a petroleum‐contaminated site

2009· article· en· W2095781438 sur OpenAlexaff
Victoria A. Parisi, Gaylen R. Brubaker, Matthew J. Zenker, Roger C. Prince, Lisa M. Gieg, Marcio L. B. Da Silva, Pedro J. J. Alvarez, Joseph M. Suflita

Notice bibliographique

RevueMicrobial Biotechnology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBioremediationEnvironmental chemistryBiostimulationBiodegradationEthylbenzeneChemistryTolueneBenzeneAlkylbenzenesHydrocarbonAnaerobic bacteriaBTEXContaminationBacteriaOrganic chemistryBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Field metabolomics and laboratory assays were used to assess the in situ anaerobic attenuation of hydrocarbons in a contaminated aquifer underlying a former refinery. Benzene, ethylbenzene, 2-methylnaphthalene, 1,2,4- and 1,3,5-trimethylbenzene were targeted as contaminants of greatest regulatory concern (COC) whose intrinsic remediation has been previously reported. Metabolite profiles associated with anaerobic hydrocarbon decay revealed the microbial utilization of alkylbenzenes, including the trimethylbenzene COC, PAHs and several n-alkanes in the contaminated portions of the aquifer. Anaerobic biodegradation experiments designed to mimic in situ conditions showed no loss of exogenously amended COC; however, a substantive rate of endogenous electron acceptor reduction was measured (55 ± 8 µM SO(4) day(-1)). An assessment of hydrocarbon loss in laboratory experiments relative to a conserved internal marker revealed that non-COC hydrocarbons were being metabolized. Purge and trap analysis of laboratory assays showed a substantial loss of toluene, m- and o-xylene, as well as several alkanes (C(6)-C(12)). Multiple lines of evidence suggest that benzene is persistent under the prevailing site anaerobic conditions. We could find no in situ benzene intermediates (phenol or benzoate), the parent molecule proved recalcitrant in laboratory assays and low copy numbers of Desulfobacterium were found, a genus previously implicated in anaerobic benzene biodegradation. This study also showed that there was a reasonable correlation between field and laboratory findings, although with notable exception. Thus, while the intrinsic anaerobic bioremediation was clearly evident at the site, non-COC hydrocarbons were preferentially metabolized, even though there was ample literature precedence for the biodegradation of the target molecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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