Modular Skeletal Evolution in Sticklebacks Is Controlled by Additive and Clustered Quantitative Trait Loci
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Notice bibliographique
Résumé
Understanding the genetic architecture of evolutionary change remains a long-standing goal in biology. In vertebrates, skeletal evolution has contributed greatly to adaptation in body form and function in response to changing ecological variables like diet and predation. Here we use genome-wide linkage mapping in threespine stickleback fish to investigate the genetic architecture of evolved changes in many armor and trophic traits. We identify >100 quantitative trait loci (QTL) controlling the pattern of serially repeating skeletal elements, including gill rakers, teeth, branchial bones, jaws, median fin spines, and vertebrae. We use this large collection of QTL to address long-standing questions about the anatomical specificity, genetic dominance, and genomic clustering of loci controlling skeletal differences in evolving populations. We find that most QTL (76%) that influence serially repeating skeletal elements have anatomically regional effects. In addition, most QTL (71%) have at least partially additive effects, regardless of whether the QTL controls evolved loss or gain of skeletal elements. Finally, many QTL with high LOD scores cluster on chromosomes 4, 20, and 21. These results identify a modular system that can control highly specific aspects of skeletal form. Because of the general additivity and genomic clustering of major QTL, concerted changes in both protective armor and trophic traits may occur when sticklebacks inherit either marine or freshwater alleles at linked or possible "supergene" regions of the stickleback genome. Further study of these regions will help identify the molecular basis of both modular and coordinated changes in the vertebrate skeleton.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle