A Selenoprotein in the Plant Kingdom
Notice bibliographique
Résumé
Selenoproteins that contain the rare amino acid selenocysteine in their primary structure have been identified in diverse organisms such as viruses, bacteria, archea, and mammals, but so far not in yeast or plants. Among the most thoroughly investigated families of selenoenzymes are the animal glutathione peroxidases (GPXs). In the last few years, genes encoding GPX-like homologues from Chlamydomonas and higher plants have been isolated, but, unlike the animal ones, all of them have cysteine (rather than selenocysteine) residues in their catalytic site. In all organisms investigated that contain selenoproteins, selenocysteine is encoded by a UGA opal codon, which is usually a stop codon. We report here that, in Chlamydomonas reinhardtii, the cDNA-cloned sequence of a GPX homologue contains an internal TGA codon in frame to the ATG. Specific mRNA expression, protein production, and enzyme activity are selenium-dependent. Sequence analysis of the peptides produced by proteolytic digestion, performed by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), confirmed the presence of a selenocysteine residue at the predicted site and suggest its location in the mitochondria. Thus, our data present the first direct proof that a UGA opal codon is decoded in the plant kingdom to incorporate selenocysteine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».