The splice variants of UBF differentially regulate RNA polymerase I transcription elongation in response to ERK phosphorylation
Notice bibliographique
Résumé
The mammalian architectural HMGB-Box transcription factor UBF is ubiquitously expressed in two variant forms as the result of a differential splicing event, that in the UBF2 deletes 37 amino acid from the second of six HMGB-boxes. Several attempts to define a function for this shorter UBF2 protein have been less than satisfactory. However, since all mammals appear to display similar levels of the longer and shorter UBF variants, it is unlikely that UBF2 is simply nonfunctional. Previously we showed that phosphorylation of UBF by the MAP-kinase ERK regulates chromatin folding and transcription elongation, explaining the rapid response of the ribosomal RNA genes to growth factors. Here we have investigated the roles the UBF variants play in the response of these genes to ERK activity. We demonstrate that the variant HMGB-box 2 of UBF2 has lost the ability to bind bent DNA and hence to induce chromatin folding. As a result it is significantly less effective than UBF1 at arresting RNAPI elongation but at the same time is more responsive to ERK phosphorylation. Thus, UBF2 functionally simulates a hemi-phosphorylated UBF whose expression may provide a means by which to tune the response of the ribosomal RNA genes to growth factor stimulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».