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Enregistrement W2095931382 · doi:10.1136/gut.2004.058982

Roles of <i>virD4</i> and <i>cagG</i> genes in the <i>cag</i> pathogenicity island of <i>Helicobacter pylori</i> using a Mongolian gerbil model

2005· article· en· W2095931382 sur OpenAlexfundno aff
Hiroyasu Saito

Notice bibliographique

RevueGut · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesJapan Society for the Promotion of ScienceHokuto Foundation for BioscienceNational Institutes of HealthUniversity of AlbertaOffice of Research and DevelopmentU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBiologyGerbilMutantInflammationHelicobacter pyloriPathogenesisGeneImmunologyGeneticsInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: The roles of the virD4 and the cagG genes in the cag pathogenicity island of Helicobacter pylori for gastroduodenal pathogenesis are unclear and their roles in vivo have not been examined. METHODS: Seven week old male Mongolian gerbils were inoculated with the wild type H pylori TN2GF4, its isogenic virD4, or cagG mutants. Animals were sacrificed at 4, 12, and 24 weeks after inoculation. Gastric inflammation and H pylori density were evaluated by histology, inflammatory response (as measured by interleukin (IL)-1beta mRNA levels), proliferative activity (as assessed by 5'-bromo-2'deoxyuridine labelling indices), and host systemic reaction (as measured by anti-H pylori IgG antibody). RESULTS: Degree of gastric inflammation, proliferative activity, and mucosal IL-1beta mRNA levels remained low throughout the first 12 weeks in gerbils infected with the virD4 mutants. Degree of gastric inflammation and proliferative activity increased at 24 weeks with the virD4 mutants reaching levels comparative with those seen at four weeks with the wild-type strains. Mucosal IL-1beta mRNA levels were also increased at 24 weeks with the virD4 mutants and levels at 24 weeks were similar between the wild-type and virD4 mutants. In contrast, gerbils infected with the cagG mutants had reduced ability to colonise gerbils, and no or little gastric inflammation or proliferative activity was observed. CONCLUSIONS: Loss of the virD4 gene temporally retarded but did not abrogate gastric inflammation. Loss of the cagG gene abolished gastric inflammation partially via reduced ability to colonise gerbils. Unknown factors related to the type IV secretion system other than CagA may influence gastric inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,240
Score d'incertitude au seuil0,947

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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