Polyalanine expansion in the <i>ZIC3</i> gene leading to X-linked heterotaxy with VACTERL association: a new polyalanine disorder?
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The VACTERL association is a non-random association of congenital defects with an unknown aetiology in the majority of patients. METHODS: A male newborn is reported with features of the VACTERL association, including anal atresia, laryngeal and oesophageal atresia with tracheo-oesophageal fistula, dextroposition of the heart with persistent left superior vena cava, and unilateral multicystic kidney. As the clinical picture of this patient overlaps with that of X-linked heterotaxy caused by ZIC3 mutations, the ZIC3 coding region was sequenced. RESULTS: In a patient with the VACTERL association a 6-nucleotide insertion was found in the GCC repeat of the ZIC3 gene, which is predicted to expand the amino-terminal polyalanine repeat from 10 to 12 polyalanines. The polyalanine expansion is a novel ZIC3 mutation which was not found in 336 chromosomes from 192 ethnically matched controls. The mutation was also not present in the mother, suggesting it occurred de novo in the patient and is therefore a pathogenetic mutation. CONCLUSION: It is hypothesized that this novel and de novo polyalanine expansion in ZIC3 contributes to the VACTERL association in this patient. A newborn male is described with features of the VACTERL association, including anal atresia, laryngeal and oesophageal atresia with tracheo-oesophageal fistula, dextroposition of the heart with persistent left superior vena cava, and unilateral multicystic kidney. As the clinical picture of the VACTERL association overlaps with X-linked heterotaxy caused by ZIC3 mutations, the ZIC3 coding region was sequenced, and a 6-nucleotide insertion was found that is predicted to expand the amino-terminal polyalanine repeat from 10 to 12 polyalanines. This novel mutation was not present in the mother, nor in 336 chromosomes from 192 ethnically matched controls. It is hypothesised that this novel and de novo polyalanine expansion in the ZIC3 gene contributes to the VACTERL association in this patient.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».