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Enregistrement W2096060072 · doi:10.5376/jmr.2014.04.0013

Molecular Characterization of Mosquitoes of <i>Anopheles gambiae</i> Species Complex (Diptera: Culicidae) from Sudan and Republic of Southern Sudan

2014· article· en· W2096060072 sur OpenAlexvenueno aff
Asma Hamza, El Amin El-Rayah, Sumaia Abukashawa

Notice bibliographique

RevueJournal of Mosquito Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnopheles gambiaeBiologyAnophelesZoologyMalariaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mosquitoes of the Anopheles gambiae complex, namely Anopheles arabiensis (Patton, 1905) and Anopheles gambiae (Giles, 1902) are the major vectors of human malaria in the African continent. This study was conducted mainly to investigate the molecular biologyof members of the An. gambiae complex in Sudan and Republic of Southern Sudan. The molecular investigation involved identification of members of the An. gambiae complex using polymerase chain reaction (PCR) techniques based on DNA specific nucleotide differences in the intergenic spacer region (IGS) of the ribosomal RNA gene claster (rRNA) and partial sequencing and analysis of IGS regions. Adult Anopheles mosquitoes were collected from four sites in Kassala State, Sudan and from one site in Western Bahr El Ghazal State, Republic of Southern Sudan. In addition, An. arabiensis specimens, obtained from Sennar town laboratory colony (Sudan) was used in the study. Collection of Anopheles mosquitoes was done by hand capture using sucking tube (aspirator) during the rainy seasons of 2008, 2009 and 2010. The molecular investigation predicts the existence of two species within the An. gambiae complex, namely An. arabiensis and An. gambiae . An. arabiensis was found as the predominant Anopheles mosquitoes in all the collection sites while An. gambiae was found sympatrically with An. arabiensis in Republic of Southern Sudan. The analysis of the IGS fragments revealed moderate level of genetic variations within and between the An. arabiensis populations. An. gambiae individuals showed high genetic similarity. The genetic analysis revealed little population differentiation ( F st=0.067) and high migration rate (Nm=3.51) which indicated high gene flow between An. arabiensis populations collected from Kassala State localities. The phylogenetic relationships between the different populations of An. arabiensis and An. gambiae were investigated. The IGS regions of rRNA gene have been shown to be powerful markers for species identification and studying the genetic structure of members of An. gambiae complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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