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Novel genomic imbalances in embryonal rhabdomyosarcoma revealed by comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization: An Intergroup Rhabdomyosarcoma Study

2000· article· en· W2096087550 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésRhabdomyosarcomaComparative genomic hybridizationFluorescence in situ hybridizationBiologyLocus (genetics)Chromosomal regionIn situ hybridizationChromosomeGeneticsMolecular biologyPathologyCancer researchGeneSarcomaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A comparative genomic hybridization (CGH) approach provides identification of genomic gains and losses in a tumor specimen in a single experiment. Only 11 embryonal rhabdomyosarcomas (E-RMS) have previously been subjected to CGH. The underlying genetic events in this histologic subtype are not well defined. In this investigation, 12 E-RMS specimens from 10 patients entered into Intergroup Rhabdomyosarcoma Study (IRS) I-IV and two local patients were analyzed by CGH and fluorescence in situ hybridization (FISH). Gains of chromosomes or chromosomal regions 2 (50%), 7 (42%), 8 (67%), 11 (42%), 12 (58%), 13q21 (33%), and 20 (33%) and losses of 1p35-36.3 (42%), 6 (33%), 9q22 (33%), 14q21-32 (25%), and 17 (25%) were most prominent. Chromosomal regions 1p35-36.3 and 9q22 represent novel regions of loss. Importantly, loss of 9q22 corresponds to the locus of a putative tumor suppressor gene (PTCH), which has been shown to play a role in rhabdomyosarcoma in a mouse model of Gorlin syndrome. Loss of 1p36 corresponds to the locus for PAX7, a paired box containing gene characteristically altered in alveolar rhabdomyosarcoma. Moreover, loss of 1p36 is prominent in another common pediatric soft tissue tumor, neuroblastoma. Gains of 2, 7, 8, 12, and 13 and loss of 14 were seen in the sole prior E-RMS CGH series; thus, these data provide important confirmatory results. In contrast to this previous study, however loss, not gain, of chromosome 17 was observed in the current study. Chromosome 17 loss correlates well with previous descriptions of frequent allelic loss of 17p (TP53) in E-RMS. In summary, CGH and FISH analyses of 12 E-RMS specimens revealed novel genomic imbalances that may be useful in directing further molecular studies for the determination of E-RMS critically involved genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,124
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle