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Enregistrement W2096093312 · doi:10.1128/mbio.00191-12

A Two-Step Mechanism for the Activation of Actinorhodin Export and Resistance in Streptomyces coelicolor

2012· article· en· W2096093312 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuemBio · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésActinorhodinStreptomyces coelicolorBiologyCell biologyRegulation of gene expressionMicrobiologyMutantGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many microorganisms produce secondary metabolites that have antibiotic activity. To avoid self-inhibition, the producing cells often encode cognate export and/or resistance mechanisms in the biosynthetic gene clusters for these molecules. Actinorhodin is a blue-pigmented antibiotic produced by Streptomyces coelicolor. The actAB operon, carried in the actinorhodin biosynthetic gene cluster, encodes two putative export pumps and is regulated by the transcriptional repressor protein ActR. In this work, we show that normal actinorhodin yields require actAB expression. Consistent with previous in vitro work, we show that both actinorhodin and its 3-ring biosynthetic intermediates [e.g., (S)-DNPA] can relieve repression of actAB by ActR in vivo. Importantly, an ActR mutant that interacts productively with (S)-DNPA but not with actinorhodin responds to the actinorhodin biosynthetic pathway with the induction of actAB and normal yields of actinorhodin. This suggests that the intermediates are sufficient to trigger the export genes in actinorhodin-producing cells. We further show that actinorhodin-producing cells can induce actAB expression in nonproducing cells; however, in this case actinorhodin is the most important signal. Finally, while the "intermediate-only" ActR mutant permits sufficient actAB expression for normal actinorhodin yields, this expression is short-lived. Sustained culture-wide expression requires a subsequent actinorhodin-mediated signaling step, and the defect in this response causes widespread cell death. These results are consistent with a two-step model for actinorhodin export and resistance where intermediates trigger initial expression for export from producing cells and actinorhodin then triggers sustained export gene expression that confers culture-wide resistance. IMPORTANCE Understanding the links between antibiotic resistance and biosynthesis is important for our efforts to manipulate secondary metabolism. For example, many secondary metabolites are produced at low levels; our work suggests that manipulating export might be one way to enhance yields of these molecules. It also suggests that understanding resistance will be relevant to the generation of novel secondary metabolites through the creation of synthetic secondary metabolic gene clusters. Finally, these cognate resistance mechanisms are related to mechanisms that arise in pathogenic bacteria, and understanding them is relevant to our ability to control microbial infections clinically.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle