Development of a Species-Specific Probe for<i>Pythium insidiosum</i>and the Diagnosis of Pythiosis
Notice bibliographique
Résumé
Pythium insidiosum, the only species in the genus that infects mammals, is the etiological agent of pythiosis, a granulomatous disease characterized by cutaneous and subcutaneous lesions and vascular diseases. Accurate diagnosis of pythiosis and identification of its causal agent are often inconsistent with current immunological diagnostic methods. A species-specific DNA probe was constructed by using a 530-bp HinfI fragment from the ribosomal DNA intergenic spacer of P. insidiosum. When the probe was incubated with dot blots of genomic DNA from 104 Pythium species, it hybridized only to the DNA of P. insidiosum and P. destruens-two species that have been considered conspecific. The probe also hybridized to DNA from 22 P. insidiosum isolates in this study, regardless of their geographic origin or animal host. When tested against genomic DNA from other pathogenic organisms (Aspergillus fumigatus, Basidiobolus ranarum, Conidiobolus coronatus, Lagenidium giganteum, Paracoccidioides brasiliensis, and Prototheca wickerhamii), no cross-hybridization of the probe was detected. The specificity of the probe to hybridize to genomic DNA from all isolates of P. insidiosum and not cross-react with DNA from other Pythium species or pathogens that cause symptoms similar to pythiosis in their hosts makes it a powerful tool for the accurate diagnosis of pythiosis. In addition, the probe has the potential for pathological and environmental diagnostic applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».