Swine Outbreak of Pandemic Influenza A Virus on a Canadian Research Farm Supports Human-to-Swine Transmission
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Swine outbreaks of pandemic influenza A (pH1N1) suggest human introduction of the virus into herds. This study investigates a pH1N1 outbreak occurring on a swine research farm with 37 humans and 1300 swine in Alberta, Canada, from 12 June through 4 July 2009. METHODS: The staff was surveyed about symptoms, vaccinations, and livestock exposures. Clinical findings were recorded, and viral testing and molecular characterization of isolates from humans and swine were performed. Human serological testing and performance of the human influenza-like illness (ILI) case definition were also studied. RESULTS: Humans were infected before swine. Seven of 37 humans developed ILI, and 2 (including the index case) were positive for pH1N1 by reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). Swine were positive for pH1N1 by RT-PCR 6 days after contact with the human index case and developed symptoms within 24 h of their positive viral test results. Molecular characterization of the entire viral genomes from both species showed minor nucleotide heterogeneity, with 1 amino acid change each in the hemagglutinin and nucleoprotein genes. Sixty-seven percent of humans with positive serological test results and 94% of swine with positive swab specimens had few or no symptoms. Compared with serological testing, the human ILI case definition had a specificity of 100% and sensitivity of 33.3%. The only factor associated with seropositivity was working in the swine nursery. CONCLUSIONS: Epidemiologic data support human-to-swine transmission, and molecular characterization confirms that virtually identical viruses infected humans and swine in this outbreak. Both species had mild illness and recovered without sequelae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».