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Enregistrement W2096206524 · doi:10.1093/protein/gzp066

Functional chimera of porcine pepsin prosegment and Plasmodium falciparum plasmepsin II

2009· article· en· W2096206524 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Engineering Design and Selection · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCollege of Agriculture and Bioresources, University of SaskatchewanNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésPepsinZymogenEnzymeBiochemistryChemistryChimera (genetics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proplasmepsin II (zPMII) represents a unique member of the aspartic proteinase family, with a prosegment-enzyme interaction that is thus far unique among the pepsin-like proteases. The role of the prosegment in aspartic proteinase structure and function was investigated by generating two chimeric proteins, one with the pepsinogen prosegment fused to the mature region of PMII (pepproPMII) and a second with the prosegment of PMII fused to pepsin (PMIIpropep). Both chimeras were expressed using Escherichia coli; however, PMIIpropep was extremely unstable suggesting protein misfolding. Alternatively, pepproPMII was capable of both autoactivation and hydrolysis of a synthetic substrate. Similarly, when the PMII enzyme was expressed without a prosegment, it too exhibited activity against the synthetic enzyme. CD measurements indicated that pepproPMII had reduced thermal stability when compared with zPMII. This reduction of temperature stability may have resulted from the inability of the pepsinogen prosegment to stabilize the C-terminal domain of the PMII enzyme. The ability of PMII to fold in the presence of a completely non-homologous prosegment and in its absence suggests that prosegment is not critical to obtaining a functional enzyme in all pepsin-like enzymes but likely plays a role in protein stabilization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,200
Score d'incertitude au seuil0,430

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle