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Enregistrement W2096217119 · doi:10.1128/mcb.25.9.3814-3830.2005

The Human Stress-Activated Protein kin17 Belongs to the Multiprotein DNA Replication Complex and Associates In Vivo with Mammalian Replication Origins

2005· article· en· W2096217119 sur OpenAlexafffund
Laurent Miccoli, Isabelle Frouin, Olivia Novac, Domenic Di Paola, Francis Harper, Maria Zannis‐Hadjopoulos, Giovanni Maga, Denis Biard, Jaime F. Angulo

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchElectricité de FranceMcGill University
Mots-clésBiologyReplication factor CEukaryotic DNA replicationDNA replicationMolecular biologyS phaseOrigin recognition complexControl of chromosome duplicationDNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human stress-activated protein kin17 accumulates in the nuclei of proliferating cells with predominant colocalization with sites of active DNA replication. The distribution of kin17 protein is in equilibrium between chromatin-DNA and the nuclear matrix. An increased association with nonchromatin nuclear structure is observed in S-phase cells. We demonstrated here that kin17 protein strongly associates in vivo with DNA fragments containing replication origins in both human HeLa and monkey CV-1 cells. This association was 10-fold higher than that observed with nonorigin control DNA fragments in exponentially growing cells. In addition, the association of kin17 protein to DNA fragments containing replication origins was also analyzed as a function of the cell cycle. High binding of kin17 protein was found at the G(1)/S border and throughout the S phase and was negligible in both G(0) and M phases. Specific monoclonal antibodies against kin17 protein induced a threefold inhibition of in vitro DNA replication of a plasmid containing a minimal replication origin that could be partially restored by the addition of recombinant kin17 protein. Immunoelectron microscopy confirmed the colocalization of kin17 protein with replication proteins like RPA, PCNA, and DNA polymerase alpha. A two-step chromatographic fractionation of nuclear extracts from HeLa cells revealed that kin17 protein localized in vivo in distinct protein complexes of high molecular weight. We found that kin17 protein purified within an approximately 600-kDa protein complex able to support in vitro DNA replication by means of two different biochemical methods designed to isolate replication complexes. In addition, the reduced in vitro DNA replication activity of the multiprotein replication complex after immunodepletion for kin17 protein highlighted for a direct role in DNA replication at the origins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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