Perfrin, a novel bacteriocin associated with netB positive Clostridium perfringens strains from broilers with necrotic enteritis
Notice bibliographique
Résumé
Necrotic enteritis in broiler chickens is associated with netB positive Clostridium perfringens type A strains. It is known that C. perfringens strains isolated from outbreaks of necrotic enteritis are more capable of secreting factors inhibiting growth of other C. perfringens strains than strains isolated from the gut of healthy chickens. This characteristic could lead to extensive and selective presence of a strain that contains the genetic make-up enabling to secrete toxins that cause gut lesions. This report describes the discovery, purification, characterization and recombinant expression of a novel bacteriocin, referred to as perfrin, produced by a necrotic enteritis-associated netB-positive C. perfringens strain. Perfrin is a 11.5 kDa C-terminal fragment of a 22.9 kDa protein and showed no sequence homology to any currently known bacteriocin. The 11.5 kDa fragment can be cloned into Escherichia coli, and expression yielded an active peptide. PCR detection of the gene showed its presence in 10 netB-positive C. perfringens strains of broiler origin, and not in other C. perfringens strains tested (isolated from broilers, cattle, sheep, pigs, and humans). Perfrin and NetB are not located on the same genetic element since NetB is plasmid-encoded and perfrin is not. The bacteriocin has bactericidal activity over a wide pH-range but is thermolabile and sensitive to proteolytic digestion (trypsin, proteinase K). C. perfringens bacteriocins, such as perfrin, can be considered as an additional factor involved in the pathogenesis of necrotic enteritis in broilers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».