DRD2 and PPP1R1B (DARPP-32) polymorphisms independently confer increased risk for autism spectrum disorders and additively predict affected status in male-only affected sib-pair families
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The neurotransmitter dopamine (DA) modulates executive functions, learning, and emotional processing, all of which are impaired in individuals with autism spectrum disorders (ASDs). Our previous findings suggest a role for dopamine-related genes in families with only affected males. METHODS: We examined two additional genes which affect DA function, the DRD2 and PPP1R1B (DARPP-32) genes, in a cohort of 112 male-only affected sib-pair families. Selected polymorphisms spanning these genes were genotyped and both family-based and population-based tests were carried out for association analysis. General discriminant analysis was used to examine the gene-gene interactions in predicting autism susceptibility. RESULTS: There was a significantly increased frequency of the DRD2 rs1800498TT genotype (P = 0.007) in affected males compared to the comparison group, apparently due to over-transmission of the T allele (P = 0.0003). The frequency of the PPP1R1B rs1495099CC genotype in affected males was also higher than that in the comparison group (P = 0.002) due to preferential transmission of the C allele from parents to affected children (P = 0.0009). Alleles rs1800498T and rs1495099C were associated with more severe problems in social interaction (P = 0.0002 and P = 0.0016, respectively) and communication (P = 0.0004 and P = 0.0046), and increased stereotypic behaviours (P = 0.0021 and P = 0.00072). General discriminant analysis found that the DRD2 and PPP1R1B genes additively predicted ASDs (P = 0.00011; Canonical R = 0.26) and explain ~7% of the variance in our families. All findings remained significant following corrections for multiple testing. CONCLUSION: Our findings support a role for the DRD2 and PPP1R1B genes in conferring risk for autism in families with only affected males and show an additive effect of these genes towards prediction of affected status in our families.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».