Identification of two glucocorticoid response elements in the promoter region of the ubiquitous isoform of glutamine synthetase in gulf toadfish,<i>Opsanus beta</i>
Notice bibliographique
Résumé
Unlike most teleosts, gulf toadfish have the capacity to switch from ammoniotely to ureotely as the predominate means of nitrogen excretion during periods of stress. The switch to ureotely is a result of increased glutamine synthetase (GS) mRNA expression/enzyme activity in the liver and muscle, which is initiated by cortisol. Cortisol typically affects gene expression through the action of cortisol-activated transcription factors, such as glucocorticoid receptors, which bind to glucocorticoid response elements (GRE) in the upstream regulatory region of genes. The purpose of the present study was to identify the GRE responsible for increased GS gene expression during crowding/confinement in gulf toadfish using an in vivo luciferase reporter assay. Upstream promoter regions for both the ubiquitous and gill GS isoforms were amplified by PCR. Additionally, an intron was amplified from the ubiquitous GS isoform that suggested the possibility of two discreet transcripts for the mitochondrial and cytoplasmic proteins. When tested via in vivo reporter assays, both the cytoplasmic and mitochondrial ubiquitous GS promoters showed increased luciferase activity during crowding vs. noncrowded controls; the gill GS promoter showed no effects in response to crowding. In silico analysis of the mitochondrial and cytoplasmic ubiquitous GS promoter constructs showed an overlapping section of 565 bp containing two potential GREs. Mutation of either site alone had no effect on luciferase activity vs. wild-type controls. However, when both sites were mutated a significant decrease in luciferase activity was observed. We conclude that two functional GREs combine to confer cortisol-inducible GS expression in the liver of gulf toadfish.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».