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Enregistrement W2096464732 · doi:10.1128/jvi.02118-09

Genetic and Pathobiologic Characterization of Pandemic H1N1 2009 Influenza Viruses from a Naturally Infected Swine Herd

2009· article· en· W2096464732 sur OpenAlexaffabout
Hana M. Weingartl, Yohannes Berhane, Tamiko Hisanaga, James Neufeld, Helen Kehler, Carissa Emburry-Hyatt, Kathleen Hooper-McGreevy, Samantha Kasloff, B. Dalman, J.M. Bystrom, Søren Alexandersen, Yan Li, John Pasick

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of ManitobaAgriculture Food and Rural DevelopmentCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirusOutbreakBiologyVirologyPandemicInfluenza A virusHerdVeterinary virologyH5N1 genetic structureDomestic pigDiseaseInfectious disease (medical specialty)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since its initial identification in Mexico and the United States, concerns have been raised that the novel H1N1 influenza virus might cause a pandemic of severity comparable to that of the 1918 pandemic. In late April 2009, viruses phylogenetically related to pandemic H1N1 influenza virus were isolated from an outbreak on a Canadian pig farm. This outbreak also had epidemiological links to a suspected human case. Experimental infections carried out in pigs using one of the swine isolates from this outbreak and the human isolate A/Mexico/InDRE4487/2009 showed differences in virus recovery from the lower respiratory tract. Virus was consistently isolated from the lungs of pigs infected with A/Mexico/InDRE4487/2009, while only one pig infected with A/swine/Alberta/OTH-33-8/2008 yielded live virus from the lung, despite comparable amounts of viral RNA and antigen in both groups of pigs. Clinical disease resembled other influenza virus infections in swine, albeit with somewhat prolonged virus antigen detection and delayed viral-RNA clearance from the lungs. There was also a noteworthy amount of genotypic variability among the viruses isolated from the pigs on the farm. This, along with the somewhat irregular pathobiological characteristics observed in experimentally infected animals, suggests that although the virus may be of swine origin, significant viral evolution may still be ongoing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,447

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations144
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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