An integrative approach to delimiting species in a rare but widespread mycoheterotrophic orchid
Notice bibliographique
Résumé
In the spirit of recent calls for species delimitation studies to become more pluralistic, incorporating multiple sources of evidence, we adopted an integrative, phylogeographic approach to delimiting species and evolutionarily significant units (ESUs) in the Corallorhiza striata species complex. This rare, North American, mycoheterotrophic orchid has been a taxonomic challenge regarding species boundaries, displaying complex patterns of variation and reduced vegetative morphology. We employed plastid DNA, nuclear DNA and morphometrics, treating the C. striata complex as a case study for integrative species delimitation. We found evidence for the differentiation of the endangered C. bentleyi (eastern USA) + C. striata var. involuta (Mexico) from the remaining C. striata (= C. striata s.s.; USA, Canada, Mexico). Corallorhiza striata involuta and C. bentleyi, disjunct by thousands of kilometres (Mexico-Appalachia), were genetically identical but morphologically distinct. Evidence suggests the C. striata complex represents three species: C. bentleyi, C. involuta and a widespread C. striata s.s under operational criteria of diagnosability and common allele pools. In contrast, Bayesian coalescent estimation delimited four species, but more informative loci and a resultant species tree will be needed to place higher confidence in future analyses. Three distinct groupings were identified within C. striata s.s., corresponding to C. striata striata, C. striata vreelandii, and Californian accessions, but these were not delimited as species because of occupying a common allele pool. Each comprises an ESU, warranting conservation considerations. This study represents perhaps the most geographically comprehensive example of integrative species delimitation for any orchid and any mycoheterotroph.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».