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Enregistrement W2096486324 · doi:10.1093/gerona/glp045

Methodology for Discovery of Alzheimer's Disease Blood-Based Biomarkers

2009· article· en· W2096486324 sur OpenAlexaff
Olivier Maës, Hyman M. Schipper, Howard Chertkow, Eugenia Wang

Notice bibliographique

RevueThe Journals of Gerontology Series A · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeripheral blood mononuclear cellDiseaseAlzheimer's diseaseBiomarker discoveryDried blood spotPathogenesisMedicineCognitive impairmentBiologyBioinformaticsComputational biologyNeurosciencePathologyImmunologyProteomicsGeneIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer's disease (AD) is a degenerative brain disorder. The disease also affects peripheral tissue such as peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). Delineating biochemical alterations in AD blood constituents may possibly allow the identification of accessible footprints that reflect degenerative processes within the central nervous system. Here, we describe an integrated methodology for the generation of a blood-based molecular bio-repository, including the collection of clinical and demographic data for downstream stringent sample selection and stratification for the study of molecular signatures in AD. We report the simultaneous extraction of high quality and yield of DNA, RNA, and protein from PBMCs of individuals with sporadic AD, mild cognitive impairment, and normal elderly controls. We describe experimental designs and present examples for the discovery of underlying etiopathogenetic networks in sporadic AD. We suggest that PBMC-associated biomarkers may provide insights into the pathogenesis of AD and be used to monitor disease diagnosis and progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,409
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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