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Enregistrement W2096501307 · doi:10.1107/s0907444900012890

Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of xanthine dehydrogenase and xanthine oxidase isolated from bovine milk

2000· article· en· W2096501307 sur OpenAlexaff
B.T. Eger, Ken Okamoto, Cristofer Enroth, Misako Sato, Tomoko Nishino, E.F. Pai, Takeshi Nishino

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGout, Hyperuricemia, Uric Acid
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreCanada Research ChairsOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXanthine dehydrogenaseXanthine oxidaseHypoxanthineAllopurinolDehydrogenaseXanthineChemistryCrystallizationCofactorGoutDimerEnzymeMonomerCrystallographyStereochemistryBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Xanthine dehydrogenase catalyzes the oxidation of hypoxanthine to xanthine and the further oxidation of xanthine to uric acid. The enzyme is the target of the anti-gout drug allopurinol and its involvement in postischemic reperfusion injury is presently being defined. Each subunit of the homodimeric 290 kDa enzyme contains four cofactors: one Mo-pterin, two [2Fe-2S] clusters and one FAD. Both the dehydrogenase (XDH) and the proteolytically modified oxidase form (XO) of the enzyme from bovine milk have been crystallized. XO crystals belong to space group C222(1), with unit-cell parameters a = 116.3, b = 164.4, c = 153.2 A at room temperature and a = 117.8, b = 165.4, c = 154.5 A when flash-frozen. They allow data collection to 3.3 and 2.5 A, respectively. In addition, a data set was collected from frozen XDH crystals and processed to 2.1 A. These crystals belong to space group C2, with unit-cell parameters a = 169.9, b = 124.8, c = 148.6 A, beta = 90.9 degrees. The unit-cell volumes and Matthews parameters are similar for the two crystal forms. There is one monomer per asymmetric unit in the XO crystals and a complete native dimer per asymmetric unit in the XDH crystals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,929
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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