Comprehensive analysis of mammalian miRNA* species and their role in myeloid cells
Notice bibliographique
Résumé
Processing of pre-miRNA through Dicer1 generates an miRNA duplex that consists of an miRNA and miRNA* strand. Despite the general view that miRNA*s have no functional role, we further investigated miRNA* species in 10 deep-sequencing libraries from mouse and human tissue. Comparisons of miRNA/miRNA* ratios across the miRNA sequence libraries revealed that 50% of the investigated miRNA duplexes exhibited a highly dominant strand. Conversely, 10% of miRNA duplexes showed a comparable expression of both strands, whereas the remaining 40% exhibited variable ratios across the examined libraries, as exemplified by miR-223/miR-223* in murine and human cell lines. Functional analyses revealed a regulatory role for miR-223* in myeloid progenitor cells, which implies an active role for both arms of the miR-223 duplex. This was further underscored by the demonstration that miR-223 and miR-223* targeted the insulin-like growth factor 1 receptor/phosphatidylinositol 3-kinase axis and that high miR-223* levels were associated with increased overall survival in patients with acute myeloid leukemia. Thus, we found a supporting role for miR-223* in differentiating myeloid cells in normal and leukemic cell states. The fact that the miR-223 duplex acts through both arms extends the complexity of miRNA-directed gene regulation of this myeloid key miRNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».