Non-linear intramolecular interactions and voltage sensitivity of a KV1 family potassium channel from<i>Polyorchis penicillatus</i>(Eschscholtz 1829)
Notice bibliographique
Résumé
Voltage sensitivity of voltage-gated potassium channels (VKCs) is a primary factor in shaping action potentials in excitable cells. Variation in the amino acid sequence of the channel proteins is responsible for differences in the voltage range over which the channel opens. Thus, understanding how changes in voltage sensitivity are effected by changes in channel protein sequence illuminates the functional evolution of excitability. The K(V)1-family channel jShak1, from the jellyfish Polyorchis penicillatus, differs from most other K(V)1 channels in ways that are useful for studying the problem of how voltage sensitivity is related to channel sequence. We assessed the contributions of changes in sequence of the S4, voltage sensing, helix and changes in one asparagine residue in the S2 helix, to the relative stability of the open and closed states of the channel. Mutation of the neutral S2 residue (Asn227) to glutamate stabilized the open conformation of the channel. Different modifications of charge and length in S4 favoured either the closed conformation or the open conformation. The interactions between pairs of mutations revealed that some of the S4 mutations alter the conformation of the voltage-sensing domain such that the S4 helix is constrained to be closer to the S2 helix than in the wild-type conformation. These results, taken in conjunction with three-dimensional models of the channel, identify intra-molecular interactions that control the balance between open and closed states. These interactions are likely to be relevant to understanding the functional characteristics of members of this channel family from other organisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».