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Enregistrement W2096587239 · doi:10.1139/b11-101

Genetic differentiation within the <i>Paralia longispina</i> (Bacillariophyta) species complex

2012· article· en· W2096587239 sur OpenAlexaffvenue
Michael L. MacGillivary, Irena Kaczmarska

Notice bibliographique

RevueBotany · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensMount Allison University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDiatomBotanyBiological dispersalRibosomal RNAInternal transcribed spacerTaxonSubtropicsEvolutionary biologyFrustuleGeneEcologyGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report on undiscovered genetic and morphological diversity within a diatom taxon known as Paralia longispina and propose three new, extant species of Paralia — Paralia allisonii sp. nov., Paralia crawfordii sp. nov., and Paralia ehrmanii sp. nov. — obtained from subtropical and tropical coasts of the Atlantic and Pacific oceans. Comprehensive examination and hierarchical clustering of frustule characters separated these three species from each other and from P. longispina. Each species possessed one or two unique morphological diagnostic characters. The internal transcribed spacer (ITS) region and a fragment of the small subunit (18S rRNA gene) of nuclear encoded rRNA and a portion of the 5′ end of the large subunit of the ribulose bisophosphate carboxylase (rbcL) gene of the chloroplast genome were related to the morphological groupings of monoclonal isolates of P. allisonii and P. crawfordii. The ITS2 secondary structure of the cultured clones of these two species had four helices. They differed by five hemicompensatory base changes (HCBCs) and substantial changes to the distal end of helix I, the region between helix II and helix III, and nearly all of helix IV. Our results better our understanding of the distribution of subtropical and tropical species of Paralia and have practical implications for the conservation of native microbial florae and for the possibility of ship ballast in human-mediated dispersal of these diatoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,909
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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