Genetic differentiation within the <i>Paralia longispina</i> (Bacillariophyta) species complex
Notice bibliographique
Résumé
We report on undiscovered genetic and morphological diversity within a diatom taxon known as Paralia longispina and propose three new, extant species of Paralia — Paralia allisonii sp. nov., Paralia crawfordii sp. nov., and Paralia ehrmanii sp. nov. — obtained from subtropical and tropical coasts of the Atlantic and Pacific oceans. Comprehensive examination and hierarchical clustering of frustule characters separated these three species from each other and from P. longispina. Each species possessed one or two unique morphological diagnostic characters. The internal transcribed spacer (ITS) region and a fragment of the small subunit (18S rRNA gene) of nuclear encoded rRNA and a portion of the 5′ end of the large subunit of the ribulose bisophosphate carboxylase (rbcL) gene of the chloroplast genome were related to the morphological groupings of monoclonal isolates of P. allisonii and P. crawfordii. The ITS2 secondary structure of the cultured clones of these two species had four helices. They differed by five hemicompensatory base changes (HCBCs) and substantial changes to the distal end of helix I, the region between helix II and helix III, and nearly all of helix IV. Our results better our understanding of the distribution of subtropical and tropical species of Paralia and have practical implications for the conservation of native microbial florae and for the possibility of ship ballast in human-mediated dispersal of these diatoms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».