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Enregistrement W2096610001 · doi:10.1002/mds.25600

Population‐specific frequencies for <i>LRRK2</i> susceptibility variants in the genetic epidemiology of Parkinson's disease (GEO‐PD) consortium

2013· article· en· W2096610001 sur OpenAlexaff
Michael G. Heckman, Alexandra I. Soto‐Ortolaza, Jan Aasly, Nadine Abahuni, Grazia Annesi, Justin A. Bacon, Soraya Bardien, Maria Bozi, Alexis Brice, Laura Brighina, Jonathan Carr, Marie‐Christine Chartier‐Harlin, Efthimios Dardiotis, Dennis W. Dickson, Nancy N. Diehl, Alexis Elbaz, Carlo Ferrarese, Brian Fiske, Jonathan Gibson, Rachel A. Gibson, Georgios M. Hadjigeorgiou, Nobutaka Hattori, John P. A. Ioannidis, Magdalena Boczarska‐Jedynak, Barbara Jasińska‐Myga, Beom S. Jeon, Yun Joong Kim, Christine Klein, Rejko Krüger, Elli Kyratzi, Suzanne Lesage, Chin‐Hsien Lin, Timothy Lynch, Demetrius M. Maraganore, George D. Mellick, Eugénie Mutez, Christer Nilsson, Grzegorz Opala, Sung Sup Park, Simona Petrucci, Andreas Puschmann, Aldo Quattrone, Manu Sharma, Peter A. Silburn, Young H. Sohn, Leonidas Stefanis, Vera Tadić, Jessie Theuns, Hiroyuki Tomiyama, Ryan J. Uitti, Enza Maria Valente, Christine Van Broeckhoven, Simone van de Loo, Demetrios K. Vassilatis, Carles Vilariño‐Güell, Linda R. White, Karin Wirdefeldt, Zbigniew K. Wszołek, Ruey‐Meei Wu, Fayçal Hentati, Matthew J. Farrer, Owen A. Ross

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMayo Clinic
Mots-clésLRRK2Parkinson's diseaseEpidemiologyPopulationMedicineGenetic epidemiologyDiseaseDegenerative diseaseCentral nervous system diseaseGeneticsBiologyInternal medicineEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Variants within the leucine-rich repeat kinase 2 gene are recognized as the most frequent genetic cause of Parkinson's disease. Leucine-rich repeat kinase 2 variation related to disease susceptibility displays many features that reflect the nature of complex, late-onset sporadic disorders like Parkinson's disease. METHODS: The Genetic Epidemiology of Parkinson's Disease Consortium recently performed the largest genetic association study for variants in the leucine-rich repeat kinase 2 gene across 23 different sites in 15 countries. RESULTS: Herein, we detail the allele frequencies for the novel risk factors (p.A419V and p.M1646T) and the protective haplotype (p.N551K-R1398H-K1423K) nominated in the original publication. Simple population allele frequencies not only can provide insight into the clinical relevance of specific variants but also can help genetically define patient groups. CONCLUSIONS: Establishing individual patient-based genomic susceptibility profiles that incorporate both risk factors and protective factors will determine future diagnostic and treatment strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,703

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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