MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2096678294 · doi:10.1152/japplphysiol.01165.2009

A common haplotype and the Pro582Ser polymorphism of the hypoxia-inducible factor-1α (<i>HIF1A</i>) gene in elite endurance athletes

2010· article· en· W2096678294 sur OpenAlexaff
Frank Döring, Simone Onur, Alexandra Fischer, Marcel R. Boulay, Louis Përusse, Tuomo Rankinen, Rainer Rauramaa, Bernd Wolfarth, Claude Bouchard

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Physical Performance
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHIF1AHaplotypeSingle-nucleotide polymorphismGenotypeAlleleVO2 maxBiologyMinor allele frequencyGeneticsOdds ratioAllele frequencyInternal medicineEndocrinologyGeneMedicineHeart rate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia-inducible factor-1alpha (HIF1A) is a transcription factor regulating several genes in response to hypoxic stimuli. HIF1A target genes code for proteins involved in oxygen transport, glycolytic enzymes, and glucose transporters. We investigated whether single-nucleotide polymorphisms and haplotypes in the HIF1A gene are associated with endurance performance in the Genathlete cohort, which includes 316 Caucasian male elite endurance athletes (EEA) with a maximal oxygen uptake of 79.0+/-3.5 ml.kg(-1).min(-1) (mean+/-SD) and 304 Caucasian male sedentary controls with a maximal oxygen uptake of 40.1+/-7.0 ml.kg(-1).min(-1). Six single-nucleotide polymorphisms (rs1951795, rs11158358, rs2301113, rs11549465, rs115494657, rs17099207) were genotyped with the TaqMan system. We found a nominal significant tendency for a difference between the two groups for HIF1A Pro582Ser (rs11549465) genotype distributions (Pchi2=0.017). Homozygotes of the Pro genotype were slightly more frequent in athletes than in controls (84 vs. 75%). Compared with Ser carriers, the odds ratio (OR) of being an EEA in Pro/Pro homozygotes was 1.77 [95% confidence interval (CI): 1.18-2.67, P=0.006] compared with the other genotypes. A common HIF1A haplotype (frequency: 15%), including the rs11549465 Pro allele and the minor A allele of rs17099207 in the 3' flanking region of the gene, showed a significant association with EEA status (OR: 2.37, 95% CI: 1.21-4.66, P=0.012), whereas the most prevalent haplotype (frequency: 59%) comprising the rs11549465 Pro allele and the major G allele of rs1709920 showed no association with EEA status (OR: 0.93, 95% CI: 0.58-1.50, P=0.769). We found preliminary evidence that the HIF1A Pro582Ser polymorphism and a common haplotype of the HIF1A gene may be associated with EEA status in Caucasian men.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Applied PhysiologyMême sujetGenetics and Physical PerformanceTravaux en français237 207