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Enregistrement W2096743942 · doi:10.1128/jb.01975-05

Proteomic Analysis of<i>Campylobacter jejuni</i>11168 Biofilms Reveals a Role for the Motility Complex in Biofilm Formation

2006· article· en· W2096743942 sur OpenAlexaff
Martin Kalmokoff, Patricia Lanthier, Tammy‐Lynn Tremblay, Mary Foss, Peter C. Lau, Greg Sanders, John W. Austin, John F. Kelly, Christine M. Szymanski

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitute for Biological SciencesHealth Canada
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthGenomic Health
Mots-clésBiofilmBiologyFlagellumCampylobacter jejuniMotilityGroELCell biologyMicrobiologyGroESBacterial adhesinChemotaxisBacteriaGeneticsGeneEscherichia coliReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter jejuni remains the leading cause of bacterial gastroenteritis in developed countries, and yet little is known concerning the mechanisms by which this fastidious organism survives within its environment. We have demonstrated that C. jejuni 11168 can form biofilms on a variety of surfaces. Proteomic analyses of planktonic and biofilm-grown cells demonstrated differences in protein expression profiles between the two growth modes. Proteins involved in the motility complex, including the flagellins (FlaA, FlaB), the filament cap (FliD), the basal body (FlgG, FlgG2), and the chemotactic protein (CheA), all exhibited higher levels of expression in biofilms than found in stationary-phase planktonic cells. Additional proteins with enhanced expression included those involved in the general (GroEL, GroES) and oxidative (Tpx, Ahp) stress responses, two known adhesins (Peb1, FlaC), and proteins involved in biosynthesis, energy generation, and catabolic functions. An aflagellate flhA mutant not only lost the ability to attach to a solid matrix and form a biofilm but could no longer form a pellicle at the air-liquid interface of a liquid culture. Insertional inactivation of genes that affect the flagellar filament (fliA, flaA, flaB, flaG) or the expression of the cell adhesin (flaC) also resulted in a delay in pellicle formation. These findings demonstrate that the flagellar motility complex plays a crucial role in the initial attachment of C. jejuni 11168 to solid surfaces during biofilm formation as well as in the cell-to-cell interactions required for pellicle formation. Continued expression of the motility complex in mature biofilms is unusual and suggests a role for the flagellar apparatus in the biofilm phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations277
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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