Bayesian Segregation Analysis of Somatic Cell Scores of Ontario Holstein Cattle
Notice bibliographique
Résumé
Bayesian segregation analysis using a Gibbs sampling approach was applied to four sets of simulated data and one set of field data to detect evidence of major genes affecting the evaluated trait. The substitution effect of a major gene and its allelic frequency were estimated for each set of data. For two datasets simulated with a model with no major gene effect, the resulting estimates of polygenic variance and heritability agreed with the simulated values and tests for the presence of a major gene were not significant. Analyses of two sets of data simulated with a major gene produced posterior distributions that gave significant evidence of major gene effects but underestimated the substitution values of the major gene. The segregation analysis of field data suggested that a major gene significantly affected somatic cell score (SCS) in the population of Ontario Holstein cattle. The estimated heritability of SCS was approximately 0.16. The major gene variance accounted for about 17% of the total genetic variance and the point estimate of the frequency of the allele having a positive effect on SCS was 0.30. However, the precision of these estimates is questionable based on the simulation results. The effect of the major gene may be underestimated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».