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Enregistrement W2096822640 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-07-4946

Translocations Involving the Immunoglobulin Heavy Chain Gene Locus Predict Better Survival in Gastric Diffuse Large B-Cell Lymphoma

2008· article· en· W2096822640 sur OpenAlexfundno aff
Shotaro Nakamura, Hongtao Ye, Chris M. Bacon, Alison Goatly, Hongxiang Liu, Lucy Kerr, Alison H. Banham, Berthold Streubel, Takashi Yao, Masazumi Tsuneyoshi, Antonella Savio, Morishige Takeshita, Peggy Dartigues, A. Ruskoné-Fourmestraux, Takayuki Matsumoto, Mitsuo Iida, Ming‐Qing Du

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAGE-WELLWellcome Trust
Mots-clésBCL6Chromosomal translocationFluorescence in situ hybridizationLymphomaBiologyMALT lymphomaGerminal centerImmunoglobulin heavy chainImmunophenotypingPathologyMucosa-associated lymphoid tissueDiffuse large B-cell lymphomaGene rearrangementBCL10Cancer researchB cellImmunologyAntibodyMedicineGeneticsAntigenGeneChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The pathogenesis and clinical heterogeneity of gastric diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) are poorly understood. We have comprehensively investigated the incidence and clinical significance of lymphoma-associated chromosomal translocations, particularly those involving the immunoglobulin heavy chain (IGH) gene locus, in a large series of gastric DLBCL. EXPERIMENTAL DESIGN: One hundred forty-one cases of primary gastric DLBCL [58 with mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma and 83 without MALT lymphoma] were enrolled. Translocations involving BCL6, c-MYC, FOXP1, MALT1, and IGH were investigated using interphase fluorescence in situ hybridization. In positive cases, additional fluorescence in situ hybridization was done with appropriate probes for potential partner genes. Cases were classified into germinal center B-cell-like (GCB) or non-GCB subgroups by immunophenotyping with CD10, BCL6, and MUM1. RESULTS: Translocations involving IGH were detected in 36 (32%) of 111 cases; their partner genes included BCL6 (n = 10), c-MYC (n = 5), and FOXP1 (n = 3) but remained unknown in the remaining 18 cases. t(14;18)/IGH-BCL2, t(14;18)/IGH-MALT1, and t(1;14)/BCL10-IGH were not detected in any case. t(11;18)/API2-MALT1 was detected in none of the cases, except for one case of DLBCL with MALT lymphoma, which showed positive signals only in MALT lymphoma cells. IGH-involved translocation was associated with younger age but not with any other clinicopathologic factors including GCB or non-GCB immunophenotypes. Cox multivariate analysis revealed that IGH-involved translocation, in addition to younger age and early stage, was an independent prognostic factor for better overall and EFSs. CONCLUSION: IGH-involved translocations are frequent in gastric DLBCL and seem to identify cases with favorable prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,147
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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