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Enregistrement W2096831487 · doi:10.1128/mcb.00853-07

Dephosphorylation and Caspase Processing Generate Distinct Nuclear Pools of Histone Deacetylase 4

2007· article· en· W2096831487 sur OpenAlexaff
Gabriela Paroni, Alessandra Fontanini, Nadia Cernotta, Carmela Foti, Mahesh P. Gupta, Xiang-Jiao Yang, Dario Fasino, Claudio Brancolini

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesAssociazione Italiana per la Ricerca sul Cancro
Mots-clésBiologyCell biologyHDAC4ChromatinTranscription factorHistone deacetylase 5Histone deacetylaseCell nucleusNuclear export signalNuclear localization sequenceProgrammed cell deathHistonePsychological repressionCytoplasmBiochemistryApoptosisGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

From the nucleus, histone deacetylase 4 (HDAC4) regulates a variety of cellular processes, including growth, differentiation, and survival, by orchestrating transcriptional changes. Extracellular signals control its repressive influence mostly through regulating its nuclear-cytoplasmic shuttling. In particular, specific posttranslational modifications such as phosphorylation and caspase-mediated proteolytic processing operate on HDAC4 to promote its nuclear accumulation or export. To understand the signaling properties of this deacetylase, we investigated its cell death-promoting activity and the transcriptional repression potential of different mutants that accumulate in the nucleus. Here we show that, compared to that of other nuclear forms of HDAC4, a caspase-generated nuclear fragment exhibits a stronger cell death-promoting activity coupled with increased repressive effect on Runx2- or SRF-dependent transcription. However, this mutant displays reduced repressive action on MEF2C-driven transcription. Photobleaching experiments and quantitative analysis of the raw data, based on a two-binding-state compartmental model, demonstrate the existence of two nuclear pools of HDAC4 with different chromatin-binding properties. The caspase-generated fragment is weakly bound to chromatin, whereas an HDAC4 mutant defective in 14-3-3 binding or the wild-type HDAC5 protein forms a more stable complex. The tightly bound species show an impaired ability to induce cell death and repress Runx2- or SRF-dependent transcription less efficiently. We propose that, through specific posttranslation modifications, extracellular signals control two distinct nuclear pools of HDAC4 to differentially dictate cell death and differentiation. These two nuclear pools of HDAC4 are characterized by different repression potentials and divergent dynamics of chromatin interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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