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Enregistrement W2096968286 · doi:10.1096/fj.11-201475

A pleckstrin homology‐related domain in SHIP1 mediates membrane localization during Fcγ receptor‐induced phagocytosis

2012· article· en· W2096968286 sur OpenAlexafffund
Andrew Ming‐Lum, Shaheen Shojania, Eva So, Erin McCarrell, Eileen Shaw, David M. Vu, Ida Wang, Lawrence P. McIntosh, Alice Mui

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British ColumbiaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBritish Columbia Knowledge Development FundMichael Smith Health Research BCCanada Foundation for Innovation
Mots-clésPleckstrin homology domainPhosphatidylinositolInositolChemistryPhagocytosisBiochemistryC2 domainCell biologyReceptorPhosphataseMutantEnzymeMembraneBiophysicsKinaseBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SH2 domain-containing inositol-5'-phosphatase-1 (SHIP1) inhibits inflammation by hydrolyzing phosphoinositide-3'-kinase generated membrane phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate (PIP(3)). Bioinformatic analysis of SHIP1 from multiple species revealed a pleckstrin homololgy-related (PH-R) domain, which we hypothesize mediates SHIP1's association with the membrane, a requirement for its biological function. Recombinant murine SHIP1 PH-R domain was subjected to biophysical and biochemical analysis. Residues K370 and K397 were found to be important for PH-R domain association with membrane PIP(3). Wild-type PH-R domain bound PIP(3) with 1.9 ± 0.2 nM affinity, while the affinity of a K370A/K397A substituted mutant was too low to measure. Wild-type (but not the K370A/K397A substituted) full-length SHIP1 protein, reconstitutes normal inhibition of Fcγ receptor-mediated phagocytosis when introduced into SHIP1(-/-) murine macrophages, reducing the number of phagocytic events by 2-fold as compared to SHIP1(-/-) cells. In fact, the PH-R-mediated membrane interaction appears to be a major mechanism by which SHIP1 is recruited to the membrane, since the K370A/K397A substitution reduced the recruitment of both full-length SHIP1 and the PH-R domain by ≥2-fold. We have previously shown that SHIP1 enzyme activity can be targeted for therapeutic purposes. The current studies suggest that molecules targeting the PH-R domain can also modulate SHIP1 function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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