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Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution
Richard A. Gibbs, George M. Weinstock, Michael L. Metzker, Donna M. Muzny, Erica Sodergren, Steven E. Scherer, Graham Scott, David L. Steffen, Kim C. Worley, Paula E. Burch, Geoffrey Okwuonu, Sandra Hines, Lora Lewis, Christine DeRamo, Oliver Delgado, Shannon Dugan-Rocha, George Miner, Margaret Morgan, Alicia Hawes, Rachel Gill, Mark D. Adams, Peter G. Amanatides, Holly Baden-Tillson, Mary Barnstead, Soo Chin, Cheryl Evans, Steve Ferriera, Carl Fosler, Anna Glodek, Zhiping Gu, D. E. Jennings, Cheryl Kraft, Cynthia Pfannkoch, Cynthia D. Sitter, Granger Sutton, Trevor Woodage, Hongmei Lee, Erik Gustafson, Patrick Cahill, A. Kana, Lynn Doucette‐Stamm, Robert B. Weiss, Diane M. Dunn, Eric D. Green, Robert W. Blakesley, Gerard G. Bouffard, Pieter J. de Jong, Kazutoyo Osoegawa, Baoli Zhu, Marco A. Marra, Jacqueline E. Schein, Ian Bosdet, Christopher D. Fjell, Steven J.M. Jones, Martin Krzywinski, Carrie Mathewson, Asim Siddiqui, Natasja Wye, John D. McPherson, Shaying Zhao, Claire M. Fraser, Jyoti Shetty, S. Shatsman, Keita Geer, Yixin Chen, Sofyia Abramzon, William C. Nierman, Paul Havlak, Rui Chen, K. James Durbin, R. Simons, Yanru Ren, Xingzhi Song, Bingshan Li, Yue Liu, Xiang Qin, Simon Cawley, Austin J. Cooney, Lisa M. D'Souza, Kirt Martin, Jia Qian Wu, Manuel L. Gonzalez‐Garay, Andrew Jackson, Kenneth J. Kalafus, Michael P. McLeod, Aleksandar Milosavljevic, Davinder Virk, А. А. Волков, David A. Wheeler, Zhengdong D. Zhang, Jeffrey A. Bailey, Evan E. Eichler, Eray Tüzün, Ewan Birney, Emmanuel Mongin, Abel Ureta‐Vidal, Cara Woodwark, Evgeny M. Zdobnov, Peer Bork, Mikita Suyama, David Torrents, Marina Alexandersson, Barbara J. Trask, Janet M. Young, Hui Huang, Huajun Wang, Heming Xing, Sue Daniels, Darryl Gietzen, Jeanette P. Schmidt, Kristian Stevens, Ursula Vitt, Jim Wingrove, M. Mar Albà, Josep F. Abril, Roderic Guigó, Arian F. A. Smit, Inna Dubchak, Edward M. Rubin, Olivier Couronne, Alexander Poliakov, Norbert Hübner, Detlev Ganten, Claudia Goesele, Oliver Hummel, Thomas Kreitler, Young‐Ae Lee, Jan Monti, Herbert Schulz, Heike Zimdahl, Heinz Himmelbauer, Hans Lehrach, Howard J. Jacob, Susan K. Bromberg, Jo Gullings-Handley, Michael I. Jensen‐Seaman, Anne E. Kwitek, Jozef Lazar, Dean Pasko, Peter J. Tonellato, Simon Twigger, Chris P. Ponting, José M. Duarte, Stephen Rice, Leo Goodstadt, Scott A. Beatson, Richard D. Emes, Eitan Winter, Caleb Webber, Petra Brandt, Gerald Nyakatura, Margaret Adetobi, Francesca Chiaromonte, Laura Elnitski, Pallavi Eswara, Ross C. Hardison, Minmei Hou, Diana L. Kolbe, Kateryna D. Makova, Webb Miller, Anton Nekrutenko, Cathy Riemer, Scott Schwartz, James G. Taylor, Shan Yang, Yi Zhang, Klaus Lindpaintner, T. Daniel Andrews, Mario Cáccamo, Michèle Clamp, Laura Clarke, Richard Durbin, Eduardo Eyras, Stephen M. J. Searle, Gregory M. Cooper, Serafim Batzoglou, Michael Brudno, Arend Sidow, Eric A. Stone, Bret A. Payseur, Guillaume Bourque, Carlos López-Otı́n, Xosé S. Puente, Kushal Chakrabarti, Sourav Chatterji, Colin N. Dewey, Lior Pachter, Nicolas Bray, Von Bing Yap, Anat Caspi, Glenn Tesler, Pavel A. Pevzner, D. Haussler, Krishna M. Roskin, Robert Baertsch, Hiram Clawson, Terrence S. Furey, Angie S. Hinrichs, Donna Karolchik, W. James Kent, Kate R. Rosenbloom, Heather Trumbower, Matt Weirauch, D.N. Cooper, Peter D. Stenson, Bin Ma, Michael R. Brent, Manimozhiyan Arumugam, David Shteynberg, Richard R. Copley, Martin S. Taylor, Harold Riethman, Uma Mudunuri, Jane L. Peterson, Mark Guyer, Adam L. Felsenfeld, Susan Old, Stephen Mockrin, Francis S. Collins
Notice bibliographique
RevueNature · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensWestern UniversityUniversité de MontréalCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersBC Cancer AgencyNational Institutes of HealthUniversidad de OviedoMinisterio de Ciencia y TecnologíaNational Institute of General Medical SciencesCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBundesministerium für Bildung und ForschungEuropean CommissionGobierno del Principado de AsturiasPennsylvania State UniversityUniversity of PennsylvaniaNational Human Genome Research InstituteW. M. Keck Foundation
Mots-clésSequence (biology)GenomeEvolutionary biologyBiologyEvolution of mammalsGeneticsComputational biologyGene
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations2 208
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentnon