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Enregistrement W2097043289 · doi:10.1093/carcin/23.10.1631

Modulation of the DNA damage response in UV-exposed human lymphoblastoid cells through genetic-versus functional-inactivation of the p53 tumor suppressor

2002· article· en· W2097043289 sur OpenAlexaff
Caroline Léger

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésHypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferaseDNA damageBiologyClonogenic assayLymphoblastMutagenesisApoptosisMolecular biologyMutantCancer researchGeneticsDNACell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The global cellular response to UV-induced DNA damage has been analyzed in the p53-proficient human lymphoblastoid strain TK6 versus two isogenic derivatives wherein p53 activity was abrogated by diverse experimental approaches: (i) NH32, carrying a homozygous genetic knockout of p53; and (ii) TK6-5E, expressing the human papillomavirus E6 oncoprotein which binds and functionally inactivates p53 protein. Although widely employed as such, the extent to which intracellular E6 expression faithfully models the p53 deficient state still remains uncertain. Following irradiation with UV (either monochromatic 254 nm UV or broad-spectrum simulated sunlight), relative to wild-type TK6, p53-null NH32 exhibited virtually identical clonogenic survival and kinetics of G1-S progression but was nonetheless profoundly resistant to apoptosis. In addition, there were significant qualitative and quantitative differences between NH32 and TK6 with respect to UV mutagenesis at the endogenous hypoxanthine phosphoribosyltransferase (hprt) locus. However, important disparities were observed between genetically p53-deficient NH32 and E6-expressing TK6-5E regarding the manner in which they responded to UV-induced genotoxic stress in relation to wild-type TK6. Indeed, although NH32 and TK6-5E behaved similarly with respect to UV mutagenesis at the hprt locus, there were significant differences between these strains in clonogenic survival, apoptosis, and G1-S progression. Using a well-defined isogenic system, our data clearly reveal the influence of p53 inactivation on the global response of human cells to UV-induced DNA damage, and highlight an important caveat in the field of p53 biology by directly demonstrating that this influence varies substantially depending upon whether p53 function is abrogated genetically, or through E6 oncoprotein expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,419
Score d'incertitude au seuil0,542

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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