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Enregistrement W2097058262 · doi:10.1097/00054725-200608000-00014

ADOA3R as a Therapeutic Target in Experimental Colitis: Proof by Validated High-density Oligonucleotide Microarray Analysis

2006· article· en· W2097058262 sur OpenAlexaff
Jorge A. Guzmán, Jun Yu, Zacharias E. Suntres, Andrey Bozarov, Helen J. Cooke, Najma Javed, Herbert Auer, Jeff Palatini, Hamdy H. Hassanain, Arturo J. Cardounel, Asad Javed, Iveta Grants, Jacqueline E. Wunderlich, Fievos L. Christofi

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésColitisMicroarray analysis techniquesDownregulation and upregulationInflammatory bowel diseasePharmacologyMedicineChemistryImmunologyGene expressionInternal medicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adenosine A3 receptors (ADOA3Rs) are emerging as novel purinergic targets for treatment of inflammatory diseases. Our goal was to assess the protective effect of the ADOA3R agonist N(6)-(3-iodobenzyl)-adenosine-5-N-methyluronamide (IB-MECA) on gene dysregulation and injury in a rat chronic model of 2,4,6-trinitrobenzene sulfonic acid (TNBS)--induced colitis. It was necessary to develop and validate a microarray technique for testing the protective effects of purine-based drugs in experimental inflammatory bowel disease. High-density oligonucleotide microarray analysis of gene dysregulation was assessed in colons from normal, TNBS-treated (7 days), and oral IB-MECA-treated rats (1.5 mg/kg b.i.d.) using a rat RNU34 neural GeneChip of 724 genes and SYBR green polymerase chain reaction. Analysis included clinical evaluation, weight loss assessment, and electron paramagnetic resonance imaging/spin-trap monitoring of free radicals. Remarkable colitis-induced gene dysregulation occurs in the most exceptional cluster of 5.4% of the gene pool, revealing 2 modes of colitis-related dysregulation. Downregulation occurs in membrane transporter, mitogen-activated protein (MAP) kinase, and channel genes. Upregulation occurs in chemokine, cytokine/inflammatory, stress, growth factor, intracellular signaling, receptor, heat shock protein, retinoid metabolism, neural, remodeling, and redox-sensitive genes. Oral IB-MECA prevented dysregulation in 92% of these genes, histopathology, gut injury, and weight loss. IB-MECA or adenosine suppressed elevated free radicals in ex vivo inflamed gut. Oral IB-MECA blocked the colitis-induced upregulation ( 90% of genes tested (33 of 37 genes). We conclude that our validated high-density oligonucleotide microarray analysis is a powerful technique for molecular gene dysregulation studies to assess the beneficial effects of purine-based or other drugs in experimental colitis. ADOA3R is new potential therapeutic target for inflammatory bowel disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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