High diversity of fungi associated with living parts of boreal forest bryophytes
Notice bibliographique
Résumé
Bryophytes are a dominant and functionally important component of the forest floor vegetation in boreal forests, yet little is known about the fungal diversity associated with these abundant plants. Using molecular identification, we document an ecologically and phylogenetically diverse array of fungi associated with the living parts of three widespread and abundant boreal forest bryophytes, i.e., Hylocomium splendens (Hedw.) Schimp. in B.S.G., Pleurozium schreberi (Brid.) Mitt., and Polytrichum commune Hedw. From 376 cloned ITS sequences, 158 operational taxonomic units (OTUs), roughly corresponding to the number of species, were defined based on sequence similarity searches (Fasta) and phylogenetic analyses. A main portion (62.8%) of the OTUs belonged to Ascomycota, 32.0% to Basidiomycota, 3.9% to Chytridiomycota, and 1.3% to Glomeromycota. The most common orders were Helotiales (18.6%), Agaricales (11.5%), Chaetothyriales (9.6%), and Tremellales (9.0%). Frequently detected OTUs of potentially high ecologic importance included two with high sequence similarity (>99%) to the agaric Entoloma conferendum (Britzelm.) Noordel and the endophyte Lophodermium piceae (Fckl.) Hoehn., and various OTUs with affinity to the Helotian genus Hyphodiscus. Several ectomycorrhiza-forming basidiomycetes were also detected. Most OTUs (77.2%) were only detected once and a very small overlap in composition of OTUs was observed among the three bryophytes, indicating the occurrence of an immense fungal diversity associated with boreal forest bryophytes that deserves further study.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».