Molecular cloning, recombinant protein expression, tissue distribution and functional analysis of a new c-type lysozyme from Lezhi black goat rumen
Notice bibliographique
Résumé
Zhang, P., Wang, Y., Jiang, M., Zhu, L., Li, J., Luo, M., Ren, H. and Liu, L. 2014. Molecular cloning, recombinant protein expression, tissue distribution and functional analysis of a new c-type lysozyme from Lezhi black goat rumen. Can. J. Anim. Sci. 94: 27–34. Three major distinct types of lysozymes have been identified in the animal kingdom and most lysozymes cloned from ruminants belong to the chicken-type (c-type). In this study, a new c-type lysozyme gene, named LZRLyz, was cloned and sequenced from the Lezhi black goat rumen. The LZRLyz cDNA has a 444 bp open reading frame (ORF) encoding a 147 amino acid polypeptide. The encoded polypeptide is predicted to have an 18 amino acid signal peptide, and a 129 amino acid mature protein with an isoelectric point (pI) of 6.08. The LZRLyz amino acid sequence shares 70.27% identity with the Capra hircus blood lysozyme and is grouped with other ruminants c-type lysozymes using the phylogenetic tree estimated by Neighbor-Jointing method. The recombinant expressed LZRLyz protein (pET-rLZR) shows a molecular mass of ∼33 kDa, which is consistent with the predicted fusion protein molecular mass and shows antimicrobial activity. Quantitative real-time RT-PCR analyses revealed that LZRLyz transcripts are expressed in all tested tissues with the predominant expression being observed in rumen and the weakest one in spleen. Results of this study suggest that the LZRLyz gene represents a new c-type lysozyme gene that likely functions in Lezhi black goat host immunity and digestive systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».