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Enregistrement W2097257058 · doi:10.1093/clinchem/48.8.1241

Human Kallikrein Gene 5 (KLK5) Expression by Quantitative PCR: An Independent Indicator of Poor Prognosis in Breast Cancer

2002· article· en· W2097257058 sur OpenAlexaff
George M. Yousef, Andreas Scorilas, Lianna Kyriakopoulou, Laura M. Rendl, Maria Diamandis, Riccardo Ponzone, Nicoletta Biglia, Maurizia Giai, Riccardo Roagna, P Sismondi, Eleftherios P. Diamandis

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésKallikreinBreast cancerOncologyInternal medicineProstate-specific antigenCancerProstate cancerBiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: KLK5 is a newly discovered human kallikrein gene. Many kallikrein genes have been found to be differentially expressed in various malignancies, and prostate-specific antigen (PSA; encoded by the KLK3 gene) is the best tumor marker for prostate cancer. Like the genes that encode PSA and other kallikreins, the KLK5 gene was found to be regulated by steroid hormones in the BT-474 breast cancer cell line. METHODS: We studied KLK5 expression in 179 patients with different stages and grades of epithelial breast carcinoma by quantitative reverse transcription-PCR (RT-PCR), using LightCycler((R)) technology. An optimal cutoff point equal to the detection limit (65th percentile) was used. KLK5 values were then compared with other established prognostic factors in terms of disease-free (DFS) and overall survival (OS). RESULTS: High KLK5 expression was found more frequently in pre-/perimenopausal (P = 0.026), node-positive (P = 0.029), and estrogen receptor-negative (P = 0.038) patients. In univariate analysis, KLK5 overexpression was a significant predictor of reduced DFS (P <0.001) and OS (P <0.001). Cox multivariate analysis indicated that KLK5 was an independent prognostic factor for DFS and OS. KLK5 remained an independent prognostic variable in the subgroups of patients with large tumors (>2 cm) and positive nodes. Hazard ratios derived from Cox analysis and related to DFS and OS were 2.48 (P = 0.005) and 2.37 (P = 0.009), respectively, for the node-positive group and 3.03 (P = 0.002) and 2.94 (P = 0.002), respectively, for patients with tumor sizes >2 cm. KLK5 expression was also associated with statistically significantly shorter DFS (P = 0.006) and OS (P = 0.004) in the subgroup of patients with grade I and II tumors. CONCLUSIONS: KLK5 expression as assessed by quantitative RT-PCR is an independent and unfavorable prognostic marker for breast carcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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