Genome skimming reveals the origin of the Jerusalem Artichoke tuber crop species: neither from Jerusalem nor an artichoke
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Notice bibliographique
Résumé
The perennial sunflower Helianthus tuberosus, known as Jerusalem Artichoke or Sunchoke, was cultivated in eastern North America before European contact. As such, it represents one of the few taxa that can support an independent origin of domestication in this region. Its tubers were adopted as a source of food and forage when the species was transferred to the Old World in the early 1600s, and are still used today. Despite the cultural and economic importance of this tuber crop species, its origin is debated. Competing hypotheses implicate the occurrence of polyploidization with or without hybridization, and list the annual sunflower H. annuus and five distantly related perennial sunflower species as potential parents. Here, we test these scenarios by skimming the genomes of diverse populations of Jerusalem Artichoke and its putative progenitors. We identify relationships among Helianthus taxa using complete plastomes (151 551 bp), partial mitochondrial genomes (196 853 bp) and 35S (8196 bp) and 5S (514 bp) ribosomal DNA. Our results refute the possibility that Jerusalem Artichoke is of H. annuus ancestry. We provide the first genetic evidence that this species originated recursively from perennial sunflowers of central-eastern North America via hybridization between tetraploid Hairy Sunflower and diploid Sawtooth Sunflower.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle