Isolation and Association of <i>Escherichia Coli</i> AIDA-I/STb, Rather than EAST1 Pathotype, with Diarrhea in Piglets and Antibiotic Sensitivity of Isolates
Notice bibliographique
Résumé
To identify emerging Escherichia coli that have the potential to cause diarrhea in pigs, the prevalence of E. coli pathotypes was determined among 170 and 120 isolates from diarrheic and nondiarrheic piglets, respectively. The isolates were tested for F4, F5, F6, F18, and F41 fimbriae, for E. coli attaching and effacing (EAE), porcine attaching and effacing-associated (Paa), and adhesin involved in diffuse adherence (AIDA-I) factors, for LT, STa, STb, and enteroaggregative heat-stable (EAST1) enterotoxins, and for Shiga toxins (Stxl, Stx2, and Stx2e), using DNA hybridization and polymerase chain reaction. All isolates were O-serotyped and tested for antibiotic resistance against 10 drugs. Seventeen different pathotypes, accounting for 40.0% of the isolates, were recovered from diarrheic piglets. The main pathotypes included EAST1 (13.5%), F4/LT/STb/EAST1 (6.5%), AIDA-I/STb/EAST1 (4.1%), F5/STa (2.9%), EAE/EAST1 (2.9%), and AIDA-I/F18 (2.3%). Only 3 pathotypes, EAE (11.7%), EAST1 (10.8%), and EAE/EAST1 (3.3%), were recovered from nondiarrheic piglets. Paa factor was detected in 8.8% and 7.5% of isolates from diarrheic and nondiarrheic piglets, respectively, and always was associated with other virulence determinants. Overall, 22.9% of isolates from diarrheic piglets appeared to be enteropathogens: enterotoxigenic E. coli (11.7%), enteropathogenic E. coli (3.5%), and E. coli isolates (3.0%) for which none of the above adherence factors was detected. Pathotypes AIDA-I/STb/EAST1 and AIDA-I/STb were isolated only from diarrheic piglets and accounted for 4.7% of isolates. Strains of these pathotypes induced diarrhea when inoculated into newborn colostrum-deprived pigs, in contrast to an isolate positive only for EAST1, which did not induce diarrhea. Antibiotic sensitivity test showed that isolates of the AIDA-I/STb/EAST1 and AIDA-I/STb pathotypes were the only strains sensitive to enrofloxacin, gentamicin, neomycin, and trimethoprim-sulfamethoxazole. This study showed that at least 20.5% of isolates from diarrheic piglets appeared to be associated with AIDA-I/STb pathotype and that EAST1 pathotype is probably not an important marker for diarrhea in piglets.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».