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Enregistrement W2097605596 · doi:10.1007/s00125-014-3354-1

Does genetic heterogeneity account for the divergent risk of type 2 diabetes in South Asian and white European populations?

2014· review· en· W2097605596 sur OpenAlexafffund
Zahra Sohani, Wei Q. Deng, Guillaume Paré, David Meyre, Hertzel C. Gerstein, Sonia S. Anand

Notice bibliographique

RevueDiabetologia · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensHamilton Health SciencesMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesMcMaster University
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismType 2 diabetesOdds ratioMeta-analysisPopulationGeneticsGenetic associationMedicineGenotypeDiabetes mellitusDemographyBiologyInternal medicineEnvironmental healthEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS/HYPOTHESIS: South Asians are up to four times more likely to develop type 2 diabetes than white Europeans. It is postulated that the higher prevalence results from greater genetic risk. To evaluate this hypothesis, we: (1) systematically reviewed the literature for single nucleotide polymorphisms (SNPs) predisposing to type 2 diabetes in South Asians; (2) compared risk estimates, risk alleles and risk allele frequencies of predisposing SNPs between South Asians and white Europeans; and (3) tested the association of novel SNPs discovered from South Asians in white Europeans. METHODS: MEDLINE, Embase, the Cumulative Index to Nursing and Allied Health Literature (CINAHL) and the Cochrane registry were searched for studies of genetic variants associated with type 2 diabetes in South Asians. Meta-analysis estimates for common and novel bi-allelic SNPs in South Asians were compared with white Europeans from the DIAbetes Genetics Replication And Meta-analysis (DIAGRAM) consortium. The population burden from predisposing SNPs was assessed using a genotype score. RESULTS: Twenty-four SNPs from 21 loci were associated with type 2 diabetes in South Asians after meta-analysis. The majority of SNPs increase odds of the disorder by 15-35% per risk allele. No substantial differences appear to exist in risk estimates between South Asians and white Europeans from SNPs common to both groups, and the population burden also does not differ. Eight of the 24 are novel SNPs discovered from South Asian genome-wide association studies, some of which show nominal associations with type 2 diabetes in white Europeans. CONCLUSIONS/INTERPRETATION: Based on current literature there is no strong evidence to indicate that South Asians possess a greater genetic risk of type 2 diabetes than white Europeans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,006
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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