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Enregistrement W2097613075 · doi:10.4141/cjps08046

Microsatellite diversity of soybean genotypes differing in bean pod mottle virus leaf symptom

2009· article· en· W2097613075 sur OpenAlexvenueno aff
M. A. Rouf Mian, Sung‐Taeg Kang, Margaret G. Redinbaugh

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGenotypeGenetic diversityMicrosatelliteAgronomyVeterinary medicineHorticultureAlleleGeneticsGenePopulationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bean pod mottle virus (BPMV) is a threat to soybean in most soybean [Glycine max (L.) Merr.] growing states of the USA. In the absence of complete resistance of soybean to BPMV, partial resistance can play an important role in reducing seed-yield and seed-quality losses from this virus. The objectives of this study were: (i) to evaluate plant introductions (PIs) for expression of leaf symptoms under greenhouse conditions following inoculation with BPMV, and (ii) to determine the genetic diversity among soybean genotypes with differences in leaf symptoms of BPMV. Large significant (P ≤ 0.001) differences in expression of BPMV leaf symptoms among genotypes in the greenhouse were detected. A genetic diversity study was conducted on 48 soybean genotypes differing in leaf symptoms of BPMV using 271 alleles amplified by 84 microsatellite primer pairs. The average polymorphism information content for the microsatellites was 0.53 and the average number of alleles per microsatellite was 3.23. The soybean genotypes clustered into distinct groups based on their country of origin and/or their BPMV leaf symptoms. Based on the microsatellite data, the genotypes were clustered into seven groups. Groups 1, 2 and 4 included genotypes from China only, group 3 included genotypes from the USA only and group 7 included genotypes from Japan only. Group 1 consisted of genotypes with low leaf symptoms of BPMV while group 6 was formed of genotypes with high leaf symptoms of BPMV. Key words: Bean pod mottle virus, genetic diversity, Glycine max, simple sequence repeat

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,874
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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