Genomic evaluation of oxalate‐degrading transgenic soybean in response to <i> <scp>S</scp> clerotinia sclerotiorum </i> infection
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Oxalate oxidases (OxO) catalyse the degradation of oxalic acid (OA). Highly resistant transgenic soybean carrying an OxO gene and its susceptible parent soybean line, AC Colibri, were tested for genome-wide gene expression in response to the necrotrophic, OA-producing pathogen Sclerotinia sclerotiorum using soybean cDNA microarrays. The genes with changed expression at statistically significant levels (overall F-test P-value cut-off of 0.0001) were classified into functional categories and pathways, and were analysed to evaluate the differences in transcriptome profiles. Although many genes and pathways were found to be similarly activated or repressed in both genotypes after inoculation with S. sclerotiorum, the OxO genotype displayed a measurably faster induction of basal defence responses, as observed by the differential changes in defence-related and secondary metabolite genes compared with its susceptible parent AC Colibri. In addition, the experiment presented provides data on several other transcripts that support the hypothesis that S. sclerotiorum at least partially elicits the hypersensitive response, induces lignin synthesis (cinnamoyl CoA reductase) and elicits as yet unstudied signalling pathways (G-protein-coupled receptor and related). Of the nine genes showing the most extreme opposite directions of expression between genotypes, eight were related to photosynthesis and/or oxidation, highlighting the importance of redox in the control of this pathogen.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle