Photobiont Relationships and Phylogenetic History of Dermatocarpon luridum var. luridum and Related Dermatocarpon Species
Notice bibliographique
Résumé
Members of the genus Dermatocarpon are widespread throughout the Northern Hemisphere along the edge of lakes, rivers and streams, and are subject to abiotic conditions reflecting both aquatic and terrestrial environments. Little is known about the evolutionary relationships within the genus and between continents. Investigation of the photobiont(s) associated with sub-aquatic and terrestrial Dermatocarpon species may reveal habitat requirements of the photobiont and the ability for fungal species to share the same photobiont species under different habitat conditions. The focus of our study was to determine the relationship between Canadian and Austrian Dermatocarpon luridum var. luridum along with three additional sub-aquatic Dermatocarpon species, and to determine the species of photobionts that associate with D. luridum var. luridum. Culture experiments were performed to identify the photobionts. In addition, the question of the algal sharing potential regarding different species of Dermatocarpon was addressed. Specimens were collected from four lakes in northwestern Manitoba, Canada and three streams in Austria. Three Canadian and four Austrian thalli of D. luridum var. luridum were selected for algal culturing. The nuclear Internal Transcribed Spacer (ITS) rDNA gene of the fungal partner along with the algal ITS rDNA gene was sequenced to confirm the identity of the lichen/photobiont and afterwards the same data sets were used in phylogenetic analyses to assess algal sharing. The green algal photobiont was identified as Diplosphaera chodatii (Trebouxiophyceae). The phylogenetic analyses of Canadian and Austrian D. luridum var. luridum revealed that ITS sequences are identical despite the vast geographic distance. Phylogenetic placement of D. luridum var. decipiens and D. arnoldianum suggested that a re-examination of the species status might be necessary. This study concluded that additional photobiont culture experiments should be conducted to answer the question of whether multiple photobionts are present within the genus Dermatocarpon.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».