Species extrapolation for the 21st century
Notice bibliographique
Résumé
Safety factors are used in ecological risk assessments to extrapolate from the toxic responses of laboratory test species to all species representing that group in the environment. More accurate extrapolation of species responses is important. Advances in understanding the mechanistic basis for toxicological responses and identifying molecular response pathways can provide a basis for extrapolation across species and, in part, an explanation for the variability in whole organism responses to toxicants. We highlight potential short- and medium-term development goals to meet our long-term aspiration of truly predictive in silico extrapolation across wildlife species' response to toxicants. A conceptual approach for considering cross-species extrapolation is presented. Critical information is required to establish evidence-based species extrapolation, including identification of critical molecular pathways and regulatory networks that are linked to the biological mode of action and species' homologies. A case study is presented that examines steroidogenesis inhibition in fish after exposure to fadrozole or prochloraz. Similar effects for each compound among fathead minnow, medaka, and zebrafish were attributed to similar inhibitor pharmacokinetic/pharmacodynamic distributions and sequences of cytochrome P45019A1/2 (CYP19A1/2). Rapid advances in homology modeling allow the prediction of interactions of chemicals with enzymes, for example, CYP19 aromatase, which would eventually allow a prediction of potential aromatase toxicity of new compounds across a range of species. Eventually, predictive models will be developed to extrapolate across species, although substantial research is still required. Knowledge gaps requiring research include defining differences in life histories (e.g., reproductive strategies), understanding tissue-specific gene expression, and defining the role of metabolism on toxic responses and how these collectively affect the power of interspecies extrapolation methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,015 | 0,034 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,004 |
| Communication savante | 0,004 | 0,010 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».