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Enregistrement W2097855375 · doi:10.1186/1471-2148-8-87

Intergeneric transfer of ribosomal genes between two fungi

2008· article· en· W2097855375 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBMC Evolutionary Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of China
Mots-clésBiologyEntomologyRibosomal RNAGeneticsEvolutionary biologyGeneHorizontal gene transferMycologyRibosomal DNAPhylogeneticsComputational biologyZoologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Horizontal gene transfer, also called lateral gene transfer, frequently occurs among prokaryotic organisms, and is considered an important force in their evolution. However, there are relatively few reports of transfer to or from fungi, with some notable exceptions in the acquisition of prokaryotic genes. Some fungal species have been found to contain sequences resembling those of bacterial genes, and with such sequences absent in other fungal species, this has been interpreted as horizontal gene transfer. Similarly, a few fungi have been found to contain genes absent in close relatives but present in more distantly related taxa, and horizontal gene transfer has been invoked as a parsimonious explanation. There is a paucity of direct experimental evidence demonstrating the occurrence of horizontal gene transfer in fungi. RESULTS: We found a fungal field isolate from rice (Oryzae sativa) that contains ribosomal DNA sequences from two species of fungal rice pathogens (Thanatephorus cucumeris and Ceratobasidium oryzae-sativae). This field isolate has four types of ribosomal DNA internal transcribed spacers (ITS), namely pure ITS of C. oryzae-sativae, which was dominant in this field isolate, pure ITS of T. cucumeris, and two chimeric ITS, with ITS1 derived from C. oryzae-sativae and ITS2 from T. cucumeris, or ITS1 from T. cucumeris and ITS2 from C. oryzae-sativae. The presence of chimeric forms indicates that the intergeneric hybrid was not merely composed of nuclei from the parental species, but that nuclear fusion and crossing over had taken place. CONCLUSION: Hyphae of T. cucumeris and C. oryzae-sativae are vegetatively incompatible, and do not successfully anastomose. However, they parasitize the same host, and perhaps under the influence of host enzymes targeted to weaken pathogen cells or in dying host plant tissue, the fungal hyphae lost their integrity, and normal vegetative incompatibility mechanisms were overcome, allowing the hyphae to fuse. Based on the presence of other similarly anomalous isolates from the field, we speculate that these types of intergeneric hybridization events and occurrences of horizontal gene transfer may not be so rare in the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,216
Score d'incertitude au seuil0,450

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle