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Enregistrement W2098022329 · doi:10.1074/jbc.m512073200

Functions of ERp57 in the Folding and Assembly of Major Histocompatibility Complex Class I Molecules

2006· article· en· W2098022329 sur OpenAlexafffund
Yi-Nan Zhang, Ehtesham Baig, David B. Williams

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Mots-clésFolding (DSP implementation)Major histocompatibility complexCell biologyMoleculeClass (philosophy)ChemistryBiophysicsComputational biologyBiologyBiochemistryComputer scienceGeneEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ERp57 is a thiol oxidoreductase of the endoplasmic reticulum that appears to be recruited to substrates indirectly through its association with the molecular chaperones calnexin and calreticulin. However, its functions in living cells have been difficult to demonstrate. During the biogenesis of class I histocompatibility molecules, ERp57 has been detected in association with free class I heavy chains and, at a later stage, with a large complex termed the peptide loading complex. This implicates ERp57 in heavy chain disulfide formation, isomerization, or reduction as well as in the loading of peptides onto class I molecules. In this study, we show that ERp57 does indeed participate in oxidative folding of the heavy chain. Depletion of ERp57 by RNA interference delayed heavy chain disulfide bond formation, slowed folding of the heavy chain alpha(3) domain, and caused slight delays in the transport of class I molecules from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus. In contrast, heavy chain-beta(2)-microglobulin association kinetics were normal, suggesting that the interaction between heavy chain and beta(2) -microglobulin does not depend on an oxidized alpha(3) domain. Likewise, the peptide loading complex assembled properly, and peptide loading appeared normal upon depletion of ERp57. These studies demonstrate that ERp57 is involved in disulfide formation in vivo but do not support a role for ERp57 in peptide loading of class I molecules. Interestingly, depletion of another thiol oxidoreductase, ERp72, had no detectable effect on class I biogenesis, consistent with a specialized role for ERp57 in this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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