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Enregistrement W2098027096 · doi:10.1002/cphc.201100414

Photon Counting Histogram Analysis for Two‐Dimensional Systems

2011· article· en· W2098027096 sur OpenAlexafffund
Max Anikovsky, Zach D. Wiltshire, Klaus Weißhart, Nils O. Petersen

Notice bibliographique

RevueChemPhysChem · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of AlbertaNational Institute for Nanotechnology
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Alberta
Mots-clésHistogramBrightnessPhoton countingPhotonConfocalExcitationGaussianChemistryStatistical physicsBiological systemPhysicsOpticsQuantum mechanicsComputer scienceComputational chemistryArtificial intelligenceImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Photon counting statistics in 3D photon counting histogram analysis for one-photon excitation is a function of the number of molecules of particular brightness in the excitation-detection volume of a confocal microscope. In mathematical form that volume is approximated by a three-dimensional Gaussian function which is embedded in the PCH theoretical equations. PCH theory assumes that a molecule can be found anywhere inside the excitation-detection volume with equal probability. However, one can easily imagine systems in which this assumption is violated because molecules are constrained by the geometry of the sample. For example, molecules on a surface or in a membrane would be constrained to two dimensions. To enable the analysis of such systems by PCH, the theoretical framework requires modification. Herein, we present an extension of the PCH analysis to systems where molecules exist in thin structures that are effectively two-dimensional. The method, aptly called two-dimensional photon counting histogram (2D PCH), recovers the number of fluorescent particles per unit area and their molecular brightness. Both theoretical background and experimental results are presented. The theory was tested using computer-simulated and experimental 2D PCHs obtained from confocal experiments. We demonstrate that this modification of the theoretical framework provides a tool to extract data that reveal states of aggregation, surface photophysics, and reactivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,732

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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