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Enregistrement W2098036819 · doi:10.1002/humu.22037

Haploinsufficiency of<i>SOX5</i>at 12p12.1 is associated with developmental delays with prominent language delay, behavior problems, and mild dysmorphic features

2012· article· en· W2098036819 sur OpenAlex
Allen N. Lamb, Jill A. Rosenfeld, Nicholas J. Neill, Michael E. Talkowski, Ian Blumenthal, Santhosh Girirajan, Debra Keelean-Fuller, Zheng Fan, Jill Pouncey, Cathy A. Stevens, Loren Mackay-Loder, Deborah Terespolsky, Patricia I. Bader, Kenneth N. Rosenbaum, Stephanie E. Vallee, John B. Moeschler, Roger L. Ladda, Susan L. Sell, Judith A. Martin, S. Noyce Ryan, Marilyn C. Jones, Rocio Moran, Amy Shealy, Suneeta Madan‐Khetarpal, Juliann McConnell, Urvashi Surti, Andrée Delahaye‐Duriez, Bénédicte Héron‐Longe, Eva Pipiras, Brigitte Benzacken, Sandrine Passemard, Alain Verloès, Bertrand Isidor, Cédric Le Caignec, Gwen M. Glew, Kent E. Opheim, Maria Descartes, Evan E. Eichler, Cynthia C. Morton, James F. Gusella, Roger A. Schultz, Blake C. Ballif, Lisa G. Shaffer

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensCredit Valley Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyGeneticsHaploinsufficiencyPhenotypeGeneSpeech delayTranscription factorExonGene isoform

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SOX5 encodes a transcription factor involved in the regulation of chondrogenesis and the development of the nervous system. Despite its important developmental roles, SOX5 disruption has yet to be associated with human disease. We report one individual with a reciprocal translocation breakpoint within SOX5, eight individuals with intragenic SOX5 deletions (four are apparently de novo and one inherited from an affected parent), and seven individuals with larger 12p12 deletions encompassing SOX5. Common features in these subjects include prominent speech delay, intellectual disability, behavior abnormalities, and dysmorphic features. The phenotypic impact of the deletions may depend on the location of the deletion and, consequently, which of the three major SOX5 protein isoforms are affected. One intragenic deletion, involving only untranslated exons, was present in a more mildly affected subject, was inherited from a healthy parent and grandparent, and is similar to a deletion found in a control cohort. Therefore, some intragenic SOX5 deletions may have minimal phenotypic effect. Based on the location of the deletions in the subjects compared to the controls, the de novo nature of most of these deletions, and the phenotypic similarities among cases, SOX5 appears to be a dosage-sensitive, developmentally important gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,432
Score d'incertitude au seuil0,405

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle